Mobile Suit Gundam Seed Destiny

En EC 71, Shinn a perdu ses parents et sa petite sœur de façon atroce sur l'île d'Onogoro, lors de l'affrontement entre Orb et l'Alliance Terrienne. Deux ans plus tard, le jeune garçon travaille à Armory 1, sur les PLANT, lieu où Cagalli Yula Athha a justement rendez-vous avec le président Durandal.

Trois nouveaux Mobile Suits ont été volés sur Armory 1. Shinn, à bord de l'Impulse, a pour mission de les récupérer, mais la tâche ne sera pas aisée. Le président Durandal, Cagalli et Asran rejoignent le Minerva qui devra intervenir à son tour…

Le Minerva part à la poursuite de « Bogey 1 », mais leur adversaire est plus redoutable qu'ils ne le pensaient. Par ailleurs, Lunamaria annonce au capitaine Gladys la présence de Cagalli Yula Athha et son garde du corps sur leur vaisseau.

Le président Durandal avoue à Asran qu'il connaît sa véritable identité. Pendant ce temps, le Minerva s'approche du Girty Lue, mais l'équipage de ce dernier a prévu un piège audacieux contre le vaisseau de ZAFT.

L'heure est grave : Junius 7 a changé d'orbite et se dirige droit vers la Terre. Alors que certains se réjouissent de la nouvelle, le Minerva est convié à participer aux travaux de destruction de la colonie.

Asran se joint aux travaux de destruction et y retrouve Yzak et Dearka. Néanmoins, leur mission sera chamboulée par les commanditaires responsables du changement d'orbite de Junius 7, mais aussi par le Phantom Pain…

Pour éviter un impact sans précédent sur la Terre, le Minerva décide de fragmenter au maximum Junius 7 avant leur descente sur Terre. Malheureusement, les débris de l'ancienne colonie ravageront considérablement la Terre.

Le Minerva arrive à Orb, où il sera réparé, ce qui fera grincer des dents les représentants du pays, qui ont pour objectif de s'allier à la Fédération Atlantique. Cagalli, dépassée, devra rapidement reprendre ses fonctions.

La Fédération Atlantique fait pression sur les PLANT pour en avoir le contrôle. Jibril a pour idée d'enfin éradiquer de l'espace les Coordinateurs, mais seule la manière forte prévaudra… Une nouvelle guerre est imminente.

Asran a rejoint les PLANT pour s'entretenir avec le président Durandal. Le jeune homme sera atterré d'apprendre que la guerre a repris, et restera hanté par les actes qu'a commis son père lors du précédent conflit.

Les tensions sont à leur comble entre la Terre et les PLANT. Le président Durandal fait appel au droit à la légitime défense pour justifier leur entrée en guerre. Pendant ce temps, Cagalli tente en vain d'éviter qu'Orb soit mêlée à ce nouveau conflit…

La guerre entre la Terre et les PLANT étant maintenant ancrée, le Minerva quitte rapidement Orb, qui est prête à rejoindre la Fédération Atlantique. Néanmoins, le vaisseau sera tenu en embuscade par une flotte terrienne…

Shinn est félicité pour ses exploits face à la flotte terrienne. Sur Orb, alors que Yuna met la pression à Cagalli concernant leur possible mariage, Kira et ses camarades sont attaqués par un commando armé qui vise étrangement Lacus.

Suite à l'attaque ratée d'un commando de Coordinateurs, Kira, Lacus et leurs compagnons décident d'agir de leur côté et de faire renaître l'Archangel. Leur première mission sera de secourir Cagalli de son propre mariage…

Kira explique à Cagalli la raison de leur geste. Pendant ce temps, Asran rallie le Minerva et est étonné d'apprendre qu'Orb a pactisé avec la Fédération Atlantique. Pour l'heure, le Minerva se prépare pour sa prochaine mission.

Le Phantom Pain prend en embuscade le Minerva et le Nyiragongo. L'équipage de ZAFT ne se laissera pas faire, notamment Shinn, surtout quand il verra qu'une base ennemie est en construction non loin du champ de bataille.

La faction Clyne doute de la sincérité du président Durandal, depuis la tentative d'assassinat de Lacus et l'apparition de Meer qui usurpe son identité. Plus loin, le Minerva arrive à la base de Mahamul et se prépare pour la suite.

Le Minerva va soutenir la base de Mahamul pour calmer la répression à Suez. Il leur faut détruire le Lohengrin de l'Alliance Terrienne qui empêche tout passage dans le canyon de Gulnahan. Asran a un plan en tête, et Shinn en sera la vedette…

À la base de Diocuia, où se tient un concert de Lacus Clyne, le président Durandal invite Asran, Shinn, Lunamaria, Rey et le capitaine Gladys à converser. Après les avoir félicités pour leurs exploits, il leur avoue la triste vérité sur cette guerre.

Shinn explique comment il a vécu la précédente guerre : sa vie paisible en famille à Orb, chamboulée du jour au lendemain, et les choix auxquels il n'était pas préparé et qu'il a pourtant dû faire…

En permission à Diocuia, Asran fait la rencontre de Heine, membre du Faith et bientôt affecté au Minerva. Plus tard, Shinn profite d'une balade en solitaire et tombe sur Stella, qu'il sauvera de la noyade.

Au pied du mur, l'Alliance Terrienne se tourne vers Orb pour lancer leur prochaine offensive contre ZAFT, en mer Noire. Alors que Heine crée la bonne ambiance sur le Minerva, Asran se demande s'il pourra combattre Orb…

L'Archangel crée la stupéfaction et la confusion en venant se mêler à la bataille entre ZAFT et l'Alliance Terrienne, soutenue par Orb. Cagalli exige que son pays n'intervienne pas dans ce conflit armé, mais les mots suffiront-ils pour cela ?

Perturbé par l'intervention de l'Archangel qui aura coûté la vie à Heine, Asran décide de prendre contact avec le vaisseau et demandera pour cela l'aide de Miriallia. Par ailleurs, Shinn et Rey doivent inspecter un laboratoire désaffecté.