Lois trouve Clark inanimé, un poignard de kryptonite planté dans le corps. Après le lui avoir retiré, elle s'enfuit avant qu'il ne se réveille, afin de protéger son secret.

Après le départ de Lois pour l'Egypte, le «Daily Planet» engage la journaliste Cat Grant pour la remplacer. Aussitôt, la jeune femme est prise pour cible par un certain Deadshot...

Clark est abasourdi quand Kara revient sur Terre, sans dissimuler ses pouvoirs, et lui annonce que c'est Jor El qui l'envoie. Celui-ci l'aurait missionnée pour repousser les forces du mal, estimant que Clark n'en est pas capable.

Lois tente de remonter le moral de Clark en l'emmenant à une soirée organisée par d'anciens élèves du lycée de Smallville. Clark se remémore alors les bons moments passés aux côtés de Lana et de Chloe.

Lois décide de révéler à Clark qu'elle sait qu'il n'est autre que Blur, mais se retrouve possédée par l'âme de la déesse Isis lorsqu'elle se pare du collier accidentellement rapporté d'Egypte.

Alors qu'ils partent en reportage, Lois fait part à Clark de son agacement quant à la surprotection qu'il lui accorde, et lui assure qu'elle est capable de se débrouiller toute seule.

Alors que tout le monde prépare Thanksgiving, le général Sam Lane et Lucy Lane arrivent à l'improviste chez Lois et Clark afin de leur faire une surprise. Mais la situation est tendue entre Clark et le général.

Lois découvre une vidéo réalisée par sa mère avant de mourir. Après avoir visionné ce message posthume, elle prend une grande décision concernant sa relation avec Clark. Elle se rend alors à la Forteresse, où elle se retrouve face-à-face avec Jor-El et Lara.

Tout en continuant à protéger le reste de l'équipe, Oliver s'enregistre sur le fichier des super-héros afin de suivre les directives du gouvernement.

Tess fait l'acquisition d'une boîte kryptonienne ayant appartenu à Lionel Luthor. Quand Clark active accidentellement la boîte, il est transporté dans un monde parallèle.

La loi anti-superhéros est entrée en vigueur. Très vite, les événements prennent une mauvaise tournure pour Clark et ses amis. Ainsi, l'Archer vert, qui tentait d'empêcher une agression, est attaqué par les citoyens.

Le groupe VRA relâche Clark, Oliver, Lois et Dinah, qu'il avait kidnappés lors des funérailles de Carter. Après leur libération, chacun d'eux a des flashbacks de même nature. Dans leurs visions, ils sont retenus prisonniers par Chloe.

Clark est surpris de voir Martha au journal télévisé, interviewée lors d'un rassemblement pro-justiciers. Cependant, la surprise laisse rapidement place à l'horreur quand Martha se fait tirer dessus en direct.

Chloe et Oliver sont pris pour des agents du FBI en train d'enquêter sur une série de meurtres commis par Darkseid. Ils sont kidnappés par des sbires du criminel. Celui-ci tente d'infecter Chloe avec sa force noire.

Zatanna envoie une bouteille de champagne ensorcelé à Lois et Clark pour célébrer leur enterrement de vie de célibataire. Le lendemain de la fête, personne ne se souvient de ce qui s'est passé.

Tess révéle à Clark que Conner combine à part égale les codes génétiques de ses deux pères : Lex et lui. Clark prend alors en charge l'éducation de l'enfant pour l'aider à maîtriser ses pouvoirs et s'assurer qu'il choisira de se battre du côté du bien.

Clark Kent trouve un miroir portail dans la grange. Clark Luthor le surprend et l'envoie dans un univers parallèle, où le jeune homme se heurte à Jonathan Kent, très énervé. Pendant ce temps, dans le monde réel, Clark Luthor rend visite à Tess.

Après les événements des derniers jours, Lois conseille à Clark de faire profil bas afin de ne pas attirer l'attention sur lui. En l'absence de Clark Kent, la presse se trouve rapidement un nouveau super-héros...

Tess apprend que le général Slade a été retrouvé inconscient dans la rue, preuve qu'un prisonnier a réussi à quitter la zone fantôme. Clark et Oliver décident d'y retourner pour s'assurer qu'aucun autre fantôme ne s'échappe.

Clark emmène Lois dans sa forteresse pour demander la bénédiction de leur union par Jor-el. En guise de réponse, celui-ci fait don des pouvoirs de Clark à Lois pour une journée.

A quelques heures de son union avec Lois, Clark est pris de doutes. Malgré tout, les deux jeunes gens règlent les derniers détails de leur mariage, ignorant que, de son côté, Darkseid a la ferme intention de perturber la cérémonie.

L'histoire de Clark Kent touche à sa fin lorsque le jeune homme s'apprête à revêtir le costume qui fera de lui Superman. Avec le retour de Lex Luthor, appelé à être son plus grand ennemi, la destinée du superhéros s'amorce...