Il est prêt à prendre son implacable destin en main. Clark revient à Smallville en Kal-El son alter ego…mais Martha a peut-être un moyen de lui rendre sa véritable identité. Loïs Lane vient enquêter sur le meurtre présumé de Chloé.

Tandis que Clark et Loïs sont à la recherche de Chloé, Lionel envoie un assassin pour empêcher la jeune fille de témoigner contre lui. Ce n'est pas la seule flèche que le magnat a dans son carquois : le père de Loïs prend peut-être partie pour Luthor.

Clark découvre une nouvelle ennemie en la personne d’Abigaïl Fine. Quand elle découvre que sa beauté fait du mal aux personnes qu’elle embrasse, Lana devient sa prochaine victime. Jason et Lana continuent à cacher leur relation à Clark.

Clark rejoint l’équipe de football américain. Intrigué par le comportement de ses co-équipiers, Clark et Lois mènent l'enquête et dé couvre que les pom pom girls empoisonnent l’eau de l’équipe pour transformer les joueurs en parfaits petits amis.

Lorsque Jonathan se fait voler son portefeuille, Clark prend en chasse Bart, alias “Flash” mais ne parvient pas à le capturer. Lex achète un manuscrit contenant des symboles kryptoniens. Lorsque Bart le subtilise, Clark est en danger.

Clark se rend dans la prison où est incarcéré Lionel. Lorsqu’il le surprend sur le point de poignarder Lex, il provoque un échange de corps entre Lionel et lui. Lionel met Smallville à feu et à sang. Clark doit trouver un moyen de récupérer son identité.

Chloé se trouve embringuée dans un cercle de jeu clandestin dirigé par Mikail. Lorsque Chloé découvre le secret de Mikail, il menace de la tuer si Clark ne fait pas perdre son équipe lors du prochain match.

Après que Lana ait lu un livre de magie, elle, Lois et Chloé sont possédées par des sorcières. Elles sont revenues pour se venger et se mettent en quête des puissants cristaux de Kryptonite. Clark tente alors de les arrêter...

Lex est accusé du meurtre d’une jeune fille. Clark veut prouver son innocence et demande son aide à Lionel. Pendant ce temps, Lana soupçonne la mère de Jason, Geneviève, d’avoir assisté à l’incident à Paris au cours duquel elle a été tatouée.

Une expérience conduite par Lex libère une toxine dans l’air. Les habitants intoxiqués imaginent que leurs peurs les plus profondes deviennent réalité et sombrent dans le coma. Désespérant de trouver rapidement un remède, Clark donne un peu de sang à Lex.

Une expérience conduite par Lex libère une toxine dans l’air. Les habitants intoxiqués imaginent que leurs peurs les plus profondes deviennent réalité et sombrent dans le coma. Désespérant de trouver rapidement un remède, Clark donne un peu de sang à Lex.

La vie serait-elle plus facile pour Alicia et Clark si les autres savaient qu'ils étaient dotés de superpouvoirs? Alicia crée une fausse situation de crise pour révéler son secret à la journaliste Chloé.

La grande équipe de football américain de Métropolis Université veut recruter Clark! Mais Clark se retrouve dans une impasse quand il découvre le dilemme de Geoff, la superstar de l'équipe, qui a des pouvoirs surhumains.

Assis, couché, saute! Un chien que Loïs a ramené à la ferme des Kent est doté de superpouvoirs. La force du chien est le résultat d'expériences secrètes menées par la LuthorCorp. Cette force s'avèrera utile quand Clark sera affaibli par la Kryptonite.

Jason et Lex sont en Chine à la recherche d'un cristal krytonien. Lana et Clark ne vont pas tarder à les suivre. Mais il y a une fantastique et bizarre égalité dans cette recherche à cause de la malédiction de Gertrude-Isobel.

La sœur de Loïs, Lucy Lane, arrive en ville. Pour des vacances, prétend-elle. Mais peut-on croire ce qu'elle dit? Il semble qu'un usurier soit à ses trousses. Ou peut-être est-ce ce qu'elle voudrait faire croire?

Lex contre Lex ! Après une explosion au laboratoire, Lex se sépare en deux, d'un côté normal et de l'autre mauvais. C'est Lex le mauvais qui emprisonne l'autre ; il découvre le secret de Clark et l'invite à régner sur le monde avec lui... sinon...

Pour elle c'est le grande soir! Après un accident de voiture dans le ravin rempli de Kryptonite, celle qui veut devenir la reine du bal prend possession du corps d'autres personnes - y compris celui de Chloé, qui a été élue reine du bal!

La vie secrète de Clark serait-elle un livre ouvert? Victime d'une perte de mémoire, il peut être la proie de quiconque (Lex!) essaiera de lui arracher des informations; il dépend d'une amie futée (Chloé!) pour l'empêcher de révéler ses pouvoirs.

Les Kent recueillent un bébé abandonnée dans un champ…et sont vite confrontés à un gros problème: l'enfant grandit à une vitesse exponentielle, et sa prochaine poussée risque de détruire la ville. Lionel lutte pour obtenir l'un des éléments Kryptoniens.

C'est le dernier jour de classe, Chloé est introuvable. Un élève qui veut que le lycée dure toujours a enfermé Chloé, Lana et d'autres filles dans un bâtiment secret où on a reconstitué le lycée. L'épreuve de force entre Luthor et Geneviève s'intensifie.

C'est la remise des prix. Mais la cérémonie est interrompue par un ordre d'évacuation. Une pluie de météorites va à nouveau s'abattre sur Smallville - et ceci n'est qu'une des surprises que nous réserve ce dernier et terrifiant épisode de la saison...